mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGATTGCCACGTCAT GACGTGGCAATCACTACCACA ACTGCCACATCACTAATTCGATGACGTGGCAATCACTACCACACATGAAATTCCAATTTAGCCCTTAAGAAGAGGACAAAATATTGAAGAAAGAATTGGAAACCCAGGGGTAAAATTAGAATTTCATGTATGGCAGTGATTGCCACGTCATCAAATTAGTGACATAGCAG 1 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2602b 3e-76 -80.8 .((((....(((((((((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((((.(((((.((((((..........(((....)))...........(....)..)))))).))))).))))))))))).))).)))))))))))))))))).)))))))))....)))) (-80.80)