mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAATTCCTTAGGTGCTTTT AAACACCTAAGGAATTGTACC CGATTAGGAGAAAACTTAGGTACAATTCCTTAGGTGCTTTTCGTATGGTTCTTAATTAAAAATACATATTTTTTGGATATAACAAACTTTGAGAAAATTATGGATCTGAGAAAATCATGGTAAATTTAGTTAAGAACCATACGAAAAACACCTAAGGAATTGTACCTAAGTTTTCTGCATTTGATTA 1 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2606c 1e-69 -87 ......(.((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((..(((...(((((..(((....((.(.(((....))).).)).)))..)))))......)))..))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).)......... (-87.00)