mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGATCGCATTTTAAAAGGC ATTTTAAAATTGTTCACGTT GTTTAAAACCTCTTGTCCGTATTTTAAAATTGTTCACGTTCCCTTTTTTTCGTTGTTTTTACCATTTAAAGTTCGTGTTTTTTTTGTCTTTAGTCATTCAAAAAAGTTTTTTTTTACGTTAAATCAACGTTCGCGTTTCACGACGTTTAAAAACGTCTCACTTTCATTTTTACGACGCATAGTTTTTTTTATCGTAACGATCACGTCAAAAAAGAGAAGGCCTGATCGCATTTTAAAAGGCGTTTTTTTTATTAATCA 4 1 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2615a 2e-53 -39.8 .................(((.(((((((((((.((((.(((.(((((((.(((.(((.((((.((..((((..(((((((((((((............))))))))..........(((.(((..((((....))))....((((((....))))))..........))).)))..)))).)..))))..)).)))).))).)))..))))))).))).)..))).)).))))))))).)))................ (-39.80)