mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAGTGTAGCATGCCCGTT CGGGGTGTTACATTTGATG CTATTTAAGAAATTTTGAAATGTAGTGTAGCATGCCCGTTTGTGAATTACTGATGAATATTTTATATTTAATTACTTTTGGGTAACGGGGTGTTACATTTGATGGACAACTTAAGTAT 2 1 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2617b 1e-25 -24.42 .((((((((.....(((..((..((((((((((.(((((((.((((.......(((((((...)))))))......)))).).))))))))))))))))..))...))))))))))). (-24.42)