mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAATTCAGTTTACGTACGTT TTTACGTATGTTCAATTTAGGT GTAGGTTAATGTAATTTCAGTTTACGTATGTTCAATTTAGGTTAATGTAAATTCAGTTTACTTATGTATATGGTGTAGGTTAATGTAAATTCAGTTTACGTATATTCAATTTAGTTTAATGTAAATTCAATTTACGTATGTTAAATTTAGGTTAACGTAAATTAAGTTTACGTATGTTTATAAGAGGTTAGTATGAATTTAGTTTAGTTATGTTTAATCTAGGTTAATGTAAATTCAGTTTATTTATGTTCAATTTAAGTTAATGTAAATTAATTTTACGTATGTATATAAGAGATTAGTGTGAATTCAGTTTACGTACGTTCAATTTATGTTAATGTAA 6 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2618b 7e-42 -68.4 .((.((((((((((.((.((..((((((..((.((((((..(((((.(((((...)))))(((((((((((((((.(((((((((((((((.(((((((((.((..(......)..))))))))))).))))))).((((((((.(((((((((((((((((..(((((((((......((...(((((((....((((......))))....)))))))..))..)))))))))......))))))))).)))))))))))))))).))))))))))).))))))))))))..)))))..)))))).))..))))))..)).)).)))))))))).)). (-68.40)