mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAATTCAGTTTACGTACGTT TGTACGAATTTGGGTTGCATTC AGCATGTACCATGTACGAATTTGGGTTGCATTCTGACTAGGTATCTCTTTCAAATTATACGTAAATATATTTAAAAGAGATACGTATGTATATAAGAGGTTAGTGTGAATTTAATTTACTTATGTTTAATCTAGGTTAATGTAAATTTAATTTACTTATGAACAATTTAGATTAATGTAAATTCAATTTACTTATGTTCAATTTAAGTTAATGTAAATTAAGTTAACATATGTATATAAGAGGTTAGTGTGAATTCAGTTTACGTACGTTCAATCTAGGTTAATGTA 2 2 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2618a 6e-42 -69.3 .((((..((((((((((((.(((((((.(((.((((((..((((((((((.(((((((......))).)))).)))))))))).((((((((((.(((..(((.(((((((.(((((((......((((((((((((...((((((...))))))........)))))))))))).))))))).))))))))))..)))...((((.(((((....))))).))))..))))))))))...)))))).)))))))))).)).)))))))........)))..)))). (-69.30)