mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACGTCGGGATTTAGGGTGTT CACGCTAAAATTCAACATCCGTTATATTTGCCTTGATCTGT ACTTATTATTAAATAAAAACAACGTCGGGATTTAGGGTGTTATAAGTTGTGTTGAACTGGGTTAACAAACTCTATGTGTTTTTTACTTTCCTGCCTTTTATTTTTTTGTTTTGTTTATGCTTACTGCTAGCGTGATGTTGGAACTTTAAATGGAACATATGCTGTCTGTGCATCTGAAATTGAAACATCACATAGAACAACTTCTAATTAACACGCTAAAATTCAACATCCGTTATATTTGCCTTGATCTGTC 3 22 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 100 -51.2 ..................(((..((((((.(((((.((((((.((((((((((((......)))))....((((((((..(((((.((((.....((((((((....(((..(.(((((((.......)))))))...)..)))...))))))))...((((.......))))..)))).)))))...))))))))))))))).....)))))).)))))....(((....)))........)))))).))). (-51.20)