mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTTTTGGTCCTTGGTATTT ATACCAAGGACCAAAACCAAA CTCTGCAAATATAAAATATTTGGTTTTGGTCCTTGGTATTTTGTTTTAATCCTTGTAAAATCATTTCATATTGAAAATGGTCCCTATAATATTCATTTTAGTCCTCGTTTTGAGGGACTAAAATCAAATATTCTACATATTACAAGGACAAAATCCAATATGAATCAATTTTACAAGGACTAAAATAAAATACCAAGGACCAAAACCAAATTTTTTATATTTACAGAGA 0 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2630q 5e-113 -104.54 (((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((...(((((((((......((((...((((((..(((((((((((........)))))))))))............))))))...))))......)))))))))...)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))).))))). (-104.54)