mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGAAGTTACTAATCCTTCCA GAAGGATTAGTAACTTCAGAGA AAGTCATTTGAATTTTCATCCCTGAAGTTACTAATCCTTCCAATCTGCCCCTGCAAATATTAATCATTTGACTTTTGGTAATGACAGCCCACCTCAGCAAAAAAACCTAATTATGACCAAAAGTTAAATGATTAATATTTGCAGGGCAGATTAGAAGGATTAGTAACTTCAGAGACGAAAATTCAAATGAACTA 2 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2632a 6e-38 -105.17 .((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.((((..........................)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).)).))))))))))))).))). (-105.17)