mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTTAGTGTGCTGAATAT ATTAAACACACTAACCAAAAA GTGGGTACAAGGAATCCACTTTATTAAACACACTAACCAAAAAACTGTAATTTCTAAGATATGTTTCAAATTAAGGTGTTTTTGGTTAGTGTGCTGAATATAGTAGATTCATTGTACCCA 4 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2599 0.000000002 -49.1 .(((((((((.(((((.(((.((((...((((((((((((((((((.((((((....((......)))))))).))).)))))))))))))))...)))).))).))))).))))))))) (-49.10)