mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGATTAATATTTGCAGTGGC CACTGCAAATATTAATCATTT GTTACTAATCATTCCAATCTGCCACTGCAAATATTAATCATTTGACTTTTGGTCCTAATTAGTTTTTTTTTGCTGAGATGGGCTATCATTAGCGACGTGGTGCCTATGTGGCAAGTGATGATTGGACGAGGTGGTTGGCTTAAATAGGTCTTTTGTCCCTGCAAATATATATCATTTGAATTTTCATCCCTAAAGTTACTAATCAGATGTAATTAGGACTATTTTTCAAATGATTAATATTTGCAGTGGCAGATTGGAAGGATTAGTAA 0 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2638b 1e-135 -113.3 .(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((....((((((((((((.......((((((.(.((((((.(((((.......))))))))))).))))))).(((((..((((((((.....(((((....)))))))))))))...(((((.......))))).....))))).....................))))))))))))....)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))) (-113.30)