mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAGAAGGTTGCTCACTATTT ATAGTGAGTAGCCGATTTGGTGAAGTGATCAACCATTCTGATAAGTTTAAATCTGTTTTTTTTT AGTGATCAAACTTTTTTGGGGTAAAATAGTGAGTAGCCGATTTGGTGAAGTGATCAACCATTCTGATAAGTTTAAATCTGTTTTTTTTTACTCCTGAAACTTTTTACCATGGGTAAAAGGATTTTTCTTGGGGTATAAAAAAAAAACCAGATTTAAATTTAGCCCAAGGGTTGATGAGGTATTTTCCTCAAGAAGGTTGCTCACTATTTTACCCCAAGATGATTTCAC 5 132 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2670b 2e-32 -93.84 .(.(((((.....(((((((((((((((((((((((((..............(((((((.......((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((...)))))))))...))))..))))))...)))))))).)))))))))))))).......)))))))((((......)))).....)))))))))))))))))))))))))))))).).. (-93.84)