mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAAAAGTTTCGTTTCGGTCC ACCAAAACGAAACTTTTAATA TTGGTCCCTTAACTATTAAAAGTTTCGTTTCGGTCCCATAACTTATTTTTGGGTTTTCTTTTGGTCCCTTAACTATTAAAAGTTTCATTTTGGTCCCTTGACTTATTTTTTGGTTTCGTTTTGGTCTCTTAACTTATTTTTTTGTTTCATTTTGGTCCCTTAACTCTAATACATTCATCCTAACATAAAGGATCAAAGAGGTTGACGGAGGATGAGTTAAGGGACCAAAACGAAACCAAAAAGTAAGTTAACGGACCAAAACGAAGCTTTTAATAGTTAAGGGACCAAAACGAAACCAAAAAGTAAGTTAAGGGACCAAAACGAAACTTTTAATAGTTAAGGGACCAAAACGAAACTTTTAATAGTTAAGGGACCAAAACGAAACCTAAAAGTAAGTTAAGGGACCAAAACGAAACTTTTAATAGTTAAGGGACCA 1 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2671b 1e-96 -244.32 .(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((((((((((((((........(((.(((.................))).)))........))))))))))))))))).))))).)))))))))))))..............((((......)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).....((((((.....))))))........)))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))) (-244.32)