mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATTG GTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATTGAGGATCTTACTGGGTGGATTGAGCTGCTTAGCTATGGATCCCACAGTTCTACCCATCAGCATGTTTTGTGGTAGTCTTGTGGCTTCCATATCTGGGGAGCTTCATCTGCCTCTATAGTATCATCCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTAC 3 0 3' arm Phaseolus_vulgaris mirbase MIR159 1e-20 pvu-MIR159a 7e-96 -91.8 ((((((((((((..(((((((..((((((..(((((((..(((.(((((.(((((.((((((..((((((..(((((((...........)).)))))..))))))..)))))).))))).))))).)))..)))....))))..))))))..)))))))..)))))))))))) (-91.80)