mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG ATCAGTTTCTACTTTCTAATCATCAACTTCTTCAAACACATCATATGAATATAGCTACCTAGGTGCTGTTTTCTTTTCCAACTTCCTCATATCTTGTTCATTCCTTGCAAAGGTGAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGGAGGAGGAGAGTTCTCAGATAAACTCTTTCACCCAAAGTTTCCAATGGAAATTTACCCTCTAACACCAAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCACCCAACTTTTGCTATTTTCTTTCTCGTAATCTTCATATTTTGCATGCCCCCATGCTTGTTTTTGCAGGATCAGAATTTTCAACTCACTACCCATCTTCTTTTGTTTTACCTGTAAATATCTTTATAAAGGCCGGTGAAAATTATAGGGAAGGCAACTTCATAATTTACTTGGGAAAAAGGCTTGCCATCATTTTCATCAACATCTGAATGAATGTACTTCAGTGAAATGACAGTGACGAGTGTTGAAGGCATGCACTCACTAGCCGCTGAAAGTTGCTGAGAAGCATATGCTAAATGTGAAAGAGTAATGAATGAAAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGTGCTGGAACAGTTAACGAGAAGAAGTGAGAATCAGGAGAAGCTAGCAAGCTAGGGATTCTATGTGTCTGAGTCTGTGACTCTT 5 0 3' arm Phaseolus_vulgaris mirbase mir-166 0.0000000000002 gma-MIR166b 5e-35 -193 ...(((((((.(((.....((.(((.(((((((.............(((.(((((.((....))))))).)))..((((((((((.((...((((...........((((((((..(((.(.(.((((((..((((((..((((((((((((((.((((((((........))))))))......((((((((...))))))))..))))).........)))).)))))..))))))..)))))).)).)))..))))))))..(((((((((((((..(((((((((((.((((((..((.(((........))))).((((((((((((........((((....((....(((((((.((..(((....)))....)).))))))).....)).((((....))))..........)))).....((((.....(((((.((((...((.(((((.(......))))))))..)))).))))).((((((((....)).))))))...))))..)))))))).))))...)))..))).))))))).))))...))))..))))))))).))))...)))))))..)))))..........))))))))))))...))))))))))....((.((.((((((.........)))))).)).))... (-193.00)