mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG GGGCTTCTCTTTGTTGGCAGG TGCACAAGATATTATAGTCAATAAGCAAACCAGTTATAGGGCTTCTCTTTGTTGGCAGGAAATGACATGACCACTTCATGAAATATCTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTTGCTGCTTTAGCTTAATATGTAATCTTCTATGCTATTCAGTGCATATGATCATTCACTCCATTGAAGAGAAGCACTGAAGTAGTATGCAAGGGATCAAACAAATGACTTCATC 4 0 3' arm Phaseolus_vulgaris mirbase mir-399 0.000000000000001 mtr-MIR399p 0.0000007 -79.3 ...............(((((.((((((((.((((.(((((((..(((((..(((((((((.((..(((((.....)))))..)).)))))))))..)))))..))))))).)))).))).)))))...((...((((.(((((((((((((((...(((....)))(((.......)))..)))))).))))))))).))))...))......)))))..... (-79.30)