mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCCTGATGATGCTGCAG GGAGCATCATCAAGATTCACA AGTCACTGTTTGCTGTTGGAGCATCATCAAGATTCACAATTTTAGGGTTCTTTTTTGATTGATTTGATCAATCAGCCTTTTTATGATTGAGAATCCTGATGATGCTGCAGTGGCAATAAGTGGCT 3 0 3' arm Gossypium_hirsutum mirbase mir-172 0.000000007 tcc-MIR172a 0.0000000000004 -57.41 (((((((..((((..(((.((((((((((.(((((.(((((..(((((.......((((((((...))))))))))))).....))))).))))).)))))))))).)))..))))..))))))) (-57.41)