mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTTTGAACTGGATTTGCCGA TGCAAATCCAGTCAAAAGTTA GTCTTAGTTTGCGTCTTGACTTTTGAACTGGATTTGCCGACTTGAACTGCGTTGTTGATGGTTTCCAAAACCCGAGCCTGCAAATCCAGTCAAAAGTTAAAACCGGGCTGAGAT 2 1 5' arm Gossypium_hirsutum mirbase 100 ghr-MIR2949c 2e-48 -46.5 (((((((((((.((.(((((((((((.((((((((((.(.(((((((......)))...((((.....)))))))).).))))))))))))))))))))).))))))))))))) (-46.50)