mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTCTCTATCTGTCATC GGGTTTTAGGGTAAGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGGGTGCTTTCTTGCATGCTTGGCTTTCATGCTTGAAGCTCTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCATCCACCTCTCTCTCTCTCTCTC 0 1 5' arm Theobroma_cacao mirbase mir-156 5e-19 ghr-MIR156a 2e-39 -67.5 (((....((((..(((..((((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((.........)))))..))))))))).))))))))))))).)))))))))..)))..))))....))).. (-67.50)