mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTTGCTCTCCTTCCGTCACC GACCAGGTCTGTCAGGAAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGGGTTCTTTCTTGCATGAGTGCCTCATGCTTGAAACTTTATGTGCTTGCTCTCCTTCCGTCACCCGCCTCTTTCTCTCCCCC 3 1 5' arm Theobroma_cacao mirbase mir-156 0.0000000000001 ptc-MIR156b 4e-16 -54.3 .....((...(..(((..((((((.((((((((..((((((.((((((...((..(((((((...)))))))..)))))))).))))))..)))).)))).))))))..)))....)...))... (-54.30)