mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATTCTTCTGTCATCA AGGAGGAACTGGTGATGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATGCATGGAGCCTGCATTTCACTCCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCACCTTTCATCCCCTCACTTAA 1 1 5' arm Theobroma_cacao mirbase 100 vvi-MIR156i 4e-38 -61 ..((((....(((((.(.((.(((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(....)))))))))).)).))))))))))))).)))))))))).)).)..))))).))))...... (-61.00)