mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTTTTCTTCTGTCAATG TACGGATGAGGACGCTTTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAACTGAACATACCCAGAAAAGGCCTGTGTATGAGCAGCCTTGTGCTCTCTTTTCTTCTGTCAATGGAATTTTCTGTCAGAGTT 1 1 5' arm Theobroma_cacao mirbase 100 vvi-MIR156f 1e-19 -54.1 ....(((.((((...(((..(((((((((((.((((((((((((((..(((((.(((.......))).)))))..)))..)))))))))))..)))))))))))..)))..)))))))...... (-54.10)