mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA GCATGAGGGGAGTCATGCAGG ACCTGGGAATGGGATTGTTCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTAAGAAGCTTGTCAAAGAGTGTTGGCTGCCTTCTTACATGGCATGAGGGGAGTCATGCAGGCTTAACAATCCCAAGTTA 3 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase mir-160 0.000000000007 vvi-MIR160b 5e-28 -61.7 .........((((((((((((((.(((((((((..(((((((.(((((((...(((((......)))))...))))))).)))))))..))))))))).)))))....)))))))))..... (-61.70)