mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGAGGCAGCGGTTCATCGATC AGGAAAAAGGGTTAAAGACACTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGGGAATTTTGTTGTGAGAATAACACAAATACATGATTCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGAGCCTTACCTCTCTCTTTAA 3 0 3' arm Theobroma_cacao mirbase MIR162_2 4e-20 ghr-MIR162a 2e-49 -42 ((((....((((..(((.(.(((((.((((.((((.(((((((...((.((...((((((((((....)))))).)))).)).))...))))))).)))).)))).))))).).)))))))...))))... (-42.00)