mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CACGTGCTCCCCTTCTCCAAC CCGGGTGAGTAGCTCCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAATTGCCAATCCATTTTGGCTTCTCAAATGCCATGTCTCGCGTTCTGCACGTGCTCCCCTTCTCCAACACGGGTTCCTCGCCCTAT 2 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR164 0.0000000005 tcc-MIR164b 0.00000000003 -67.8 ..(((((((.(((.((.(((((((((((..(((((((((((.....(((((......)))))......(((((........))))).)))))))))))..))))))))))).))))).)))))))... (-67.80)