mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACATGCT CATGTGCCCTGGCTCTCCAGC GGAGAGAGGGTAAGCCATGCTGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAAGCAATCAGACAAAAATCTGAGAAATTTTGCATGTGCCCTGGCTCTCCAGCTTGGACCGTCTCCCTTAC 3 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR164 0.000000000007 ptc-MIR164f 0.00000000002 -64.3 ((.((((.(((...(((.((((((((..((((((((((((.(((....(((((......)))))....))).))))))))))))..)))))))).)))))).)))))).... (-64.30)