mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGCTGTCTGGTTCGAGA GAAGTCTTGAACAGTTGAGGGGAATGCTGTCTGGTTCGAGACCGTTCATTTGAAGCTCTAGACTTCATCAGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTTATGGAATATATAC 2 0 3' arm Theobroma_cacao mirbase mir-166 0.00000000000003 vvi-MIR166h 2e-18 -56.1 ....(((.....(((((.((((((((..(((((((((((((.(((((...((((((....).)))))...))))).)))))))))))))..)))))))).)))))...)))........ (-56.10)