mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTCTGACAGCCTCACT GAATTCTGCAGTGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTAGTGAGTGAAAGGGGGTGCTAAGGCTATGTTGCTAACCCTAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTACTTGGGGACCCA 2 2 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR167_1 2e-18 rco-MIR167a 8e-18 -50.1 ....(((.((((((((..(((((.(((((.(((((((((((.((..((((((..(.(....).....((....))....)..))))))..)).)))))))))))..).)))).)))))..)))).)).)).))).... (-50.10)