mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTCGTCTTTGGCTACA TAGGCCTAGAAAGGATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACTACTCCCTCCAGCCTTTGCTGTACTGTTTTTTATATTGAAAAAATGGATATAGATGAAGTGGGCAAGTCGTCTTTGGCTACATTTTTCTTTCTCCTCCTC 2 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR169_2 0.000000008 vvi-MIR169g 0.0000000001 -61 .(((...((((((((..(((.((((((((((((((((((.(((.(((....((((....))))..(((((((((......))))))))).....)).).))).)))))))))))))))))).)))..))))))))...))). (-61.00)