mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAAGGATGACTTGCCG AAAAGTCATTTTTGGCTCACC AAGAAAGGGACAGTGGAGTTTGAGCCAAGGATGACTTGCCGGGATATTTGCTGCGGAGCAGTATATGCCTCAACTGTCTTCCGAAAAGTCATTTTTGGCTCACCTTCGCTCTCATGTTTTCCAT 2 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR169_2 0.00003 gma-MIR169e 0.000002 -49.3 ..(((((.((.(((((((..(((((((((((((((((..((((((((.((((((...)))))).)))...........)))))..))))))))))))))))).))))))).))...)))))... (-49.30)