mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TGTTGGCACGGTTCAATCGGA GATTTCTTAGTTGAAAATTTGATGTTGGCACGGTTCAATCGGATCAAATCTCTCAGTGGCTGAGTCCTTTAGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACATTCAGTCACTGCATCGG 0 0 3' arm Theobroma_cacao mirbase MIR171_1 0.0000000000004 vvi-MIR171a 0.00000000000002 -51.9 (((....((((.((.(((.(((((((((((((((((((((((((.(((...(((((...)))))...))).))))))))))))))))))))))))).)))...)))))).))).. (-51.90)