mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATCTTGATGATGCTGCA GAGCATCATCAAGATTCACAA ACAGTCACTGTTTGCTGATGGAGCATCATCAAGATTCACAAAACTTTTTTTAGGGCTAATGATCAATGGTGAAGATCATGCTTCACTATACAATCAGCCCTTTGAATATGTATGGGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATAAATGGCTAAAT 1 1 3' arm Theobroma_cacao mirbase mir-172 0.00000000001 ghr-MIR172 0.0000000000005 -65.9 ..(((((....((((((.((.((((((((((((((((.(...((..(((..((((((...(((..(((((((((......)))))))))...)))))))))..)))...))...))))))))))))))))).)).))))))....))))).... (-65.90)