mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCCATCCTGAGTTTCA TTAGTATAGAAGAGCCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATTGATGATCTTGAATCTTATGGATTGTATAATCTGATCCTCATTAGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATCGGTTCTTCTTGCTCTTGC 2 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR390 0.0000000005 ghr-MIR390b 3e-17 -57.4 ..((((.(((((((((.((.((((((((((.(((((((((...(((.((((..((...(((((.....))))))).)))).)))...))))))))).)))))))))).)).)))))))))))))..... (-57.40)