mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCTATCCTGAGTTTCA AAAGTATGGGAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATCTCGACGAGGTTGTGTTTTAAATGTTCATCAGCTGGCGCTATCTATCCTGAGTTTCATGGGTTCTTCCTGCTATGTG 1 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR390 0.00000000003 bna-MIR390b 0.000000000002 -59 ..((((.((((((((((((.((((((((((.(((((((((((.((.((.((((((........))).))).)))).))))))))))).)))))))))).))))))))))))))))..... (-59.00)