mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCATTTGCACCTGCACCTC GGTGCAGATGCAGGTGCAGA CCAACAAGTCTCCATTTATCTGCATTTGCACCTGCACCTCTTTCTCTACACTTCCAGCAGCCAGGGAGATGAACAACATTCTCCATGGACGGTTGCCGAAATCTTGTTGGTTGGACGGGGAGAGGTGCAGATGCAGGTGCAGACAAATGGCCTCTTGGTTTTA 1 0 5' arm Theobroma_cacao mirbase MIR530 0.0000006 ptc-MIR530a 0.0000005 -76.6 ....((((...((((((.((((((((((((.((((((((((..((...((...((((((.(((.(((((((.....)).))))).))).(((...)))......)))))).))...))..)))))))))).)))))))))))).))))))...))))...... (-76.60)