mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCTT GGGACTGTTGTCTGGCTCGATG TATATGTTCTCATCTGGGTTAGCTTAGGGTTTTGAGAGCAGGAAGCCATGAAAGTCGATGGATGGGAGAAAAATGATTGTTTCTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGATGCATTAATAATAATTATAATTATATAATTATAATTATCATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCTTCAGAATCAAATTCATTGTTT 5 0 3' arm Citrus_reticulata mirbase mir-166 0.00005 csi-MIR166d 5e-23 -70.52 ......(((((((((..((..((((..((((((........))))))....))))..)))))))))))...((((((((.(((((((((((.((..((((((..((((((....((.((((((((((((....)))))))))))).)).........))))))..))))))..)).))))))))))).)))..))))).... (-70.52)