mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT AGTTACCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTAGTTTTTTTTTGAAATTTTTTGACAGCGAGGTGGCGTGTTGTAATTGGTCGTCACGTTTAAATTAATGATTGAAAAAAATGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGAGGTGAGAGATTGGATGGATATTTACCTT 3 0 5' arm Citrus_reticulata mirbase MIR168 6e-20 ccl-MIR168 2e-50 -73 ..(((((..(((((((..(((((.((((((((((.(((((.(..(((.((....(((((((..(.(((..((...((((.(..(((............)))..).))))..))..)))..)..))))))).)).)))..).))))).)))))))))).)))))..))))))).)))))....................... (-73.00)