mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAG GGGTTAAGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGTTCTAGCAAGGGTAAATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGTCCTATGTATCAGATTTTAGGGTTTGTTTCTGATGATGGTGATGATAGGCTTGTGGCTTGCATATTTCTGGACCTTCATTACCCCTTAAGTTTTTACCCCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACCTCTCTACC 2 0 3' arm Citrus_sinensis mirbase MIR159 2e-20 rco-MIR159 5e-20 -81.5 .(((..((..((((((((((((..((((((((((((((...((((((((..(((.(((.(.(.(((.((((.(..((((((.(((((.(((((....((((((.....))))))...)))))...))))).))))))..).)))).))).).).))).)))..)))))..)))...)))...)))))))))))..))))))))))))..))..))) (-81.50)