mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCCTGGCTCCCTGTATGCCAT GGCGTATGAGGAGCCATGCAT ATTATACCTATGTCTATATATTTATAATTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGTCAATCGAAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTCCATGTATAATATATACCCATAGATAT 3 0 5' arm Citrus_sinensis mirbase mir-160 7e-28 ptc-MIR160b 6e-31 -63.2 .......(((((..((((((((((((...((((((.(((((((..((((((((((..(.((((((.((((....))))))).))).)..))))))))))..))))))).))))))....)))).))))))))..))))).... (-63.20)