mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGAGGCAGCGGTTCATCGATC AAACTGTTTACACTGATCTGTGCTGCTGATAAATCTTAATTTTTTTTTTTGAATTTTTATTTAACAGAAAATAGAGAGAGTGAAGTCACTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCACTTTGTGCAAATTTTGTTGTGAAAAATAACACAAAATACATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTCCAACTCTATTC 3 0 3' arm Citrus_sinensis mirbase MIR162_2 1e-17 ghr-MIR162a 1e-26 -61 ..........(((......)))...(((.(((((...(((((........)))))...))))).)))..(((((((.((((((.(.(.(((((.((((.((((.(((((((..((..((...(((((((.((........))))))))).))..))..))))))).)))).)))).))))).))))))))...))))))). (-61.00)