mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCCTTCTTCCCCATC GTGTAGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCAACCGCACATACATCTACTAACAAAAATTAATTAATCCACACATTTTGAAGAAACCAAATCAAGAAGCAGCAAGCTCTTTCTGTTGTTATAGCTCAGTCATGAGTTGAGTTATTTCTTCATGTGCCCTTCTTCCCCATCATGACCGCGGCACCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTATCATCAGGGATCAGCTCAAGATCTGAATTTCTTCTTAGCAAAATTCATGTGCCA 4 0 5' arm Citrus_sinensis mirbase MIR164 0.000000000000001 ctr-MIR164 3e-105 -71.15 .....(..((.(((((.((((.((((((((((......(((((((((...........(((.((((((....................((((.......))))...(((((.((....)).))))).)))))))))...........)))))))))......)))))))))).)))).))))).))..)..(((((............((.((..((((.((......)).))))..)).)).....(((((((((....))..))))))).))))). (-71.15)