mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCGT GGGAATGTTGTTTGGCTCGAGG CACGCGTCCGATTGTTTGATTTTTTTTGAGAGGTTATGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGGTCATCTAGGTTTTCAAAATTTTCTCGGACTTTCTTTCTTGCTTTTATTTTTCCAGGAAAATTATGTTATTTGCCTATGTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTCAACCGACGGTTTCTCTCTT 4 0 3' arm Citrus_sinensis mirbase mir-166 0.000000003 crt-MIR166a 2e-90 -69.65 ((.(((......))).)).........((((((...(((((((((((((((..((((((..(((((.((((.(((((...((.(((((((..(((......................)))..))))))).))......))))).)))))))))..))))))..)))))))))))))))......)))))).. (-69.65)