mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCC GAATGTTGTCTGGTTCGAGA TTCCTCCTCGATCATACATGAACGGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTTCGAGATCACTCGTGGACGAATTAATTAATAACTTATTGTCTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCAGTTTAATTGC 2 0 3' arm Citrus_sinensis mirbase mir-166 0.000000000009 tcc-MIR166a 0.000000000000002 -56.39 ..................((((((((((.((((((((..((((((((((((((((.(((.((((((................))))))..))).))))))))))))))))..)))))))).)))))..)))))..... (-56.39)