mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCT GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG TTATAATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCTTCAGAATCAAATTCATTATTTGATCTTTTTGAGAGGTTATGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGGTCATCTAGGTTTTCAA 5 0 5' arm Citrus_sinensis mirbase mir-166 0.0000001 crt-MIR166a 4e-38 -36.5 ......((((((..((((.(((..((((((..(((((((.((((.(((((((.....)))))))(((.....))).......)))).)))))))..))))))..))).....))))...)))))). (-36.50)