mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG GGGGAGCTTTTTGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTACTTGTTGATCCATTAATTTTACGTATTCTCTCATAGATCTAGCATCTGAATGGTGGATAACAATATACGGATTCAGCTTATTTGGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATATATTGCTTCTAT 4 0 3' arm Citrus_sinensis mirbase mir-166 0.0000000002 ctr-MIR166 0.0000000000002 -63.6 .((((((....(((.(((.((((((((..((((((..(((.(((.(((...((((((((...........(........)....(((((.(((....))).)))))..........))).))))).....))).))).)))..))))))..)))))))).))).)))..)))))).. (-63.60)