mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGCGCCAATATCAC GATATTGGTGCGGTTCAATA TACTCACGGGATATTGGTGCGGTTCAATAAGAAAACGGTGCTCAATACTTTTTGAGCTCCGCTTTTTGATTGAGCCGCGCCAATATCACGTGCCACT 1 0 3' arm Citrus_sinensis mirbase MIR171_1 1e-19 ccl-MIR171 3e-50 -55.1 ....((((.(((((((((((((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).))))))))))))))))))).))))..... (-55.10)