mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATCTTGATGATGCTGCAG GGAGCACCATCAAGATTCACAAA ACTGTTTGCAGTTGGAGCACCATCAAGATTCACAAACTATTAGGGTTAGTGAGTGGAGATAATGGTGGCTATTTTATTTTTTTTGGCCCCTTGCTTCACTTCAAATTGCTCTTTGTTTTGGAATCTTGATGATGCTGCAGCAGCGATAAGTGGCTAAATTATA 2 1 3' arm Citrus_sinensis mirbase mir-172 0.00000004 ptc-MIR172h 0.00000000003 -61.1 (((..((((.((((.((((.(((((((((((.((((.((..(((((...(((((((((.(((.((.(((((............)))))))))))))))).)))....))))).)).))))))))))))))).)))).)))).))))..)))............ (-61.10)