mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGACTGAAGGGAGCTCCT GGGTTCCTTGCGGCCCAAAAC TCGTCTCTTAATAAAATTGGCGAAAATGGTAGAAATAGGGGTTCCTTGCGGCCCAAAACAGTTGGCTAACTCTGCTCTTCTCTCTATGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTCTTCTCTTT 2 0 3' arm Citrus_sinensis mirbase 100 vvi-MIR319e 0.0000000001 -40.54 (((((.............)))))....((.((((.((((((((((((.(((.((((((((...(((.......)))..........)))))))).))).)))))))))))).)))).)).... (-40.54)