mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTGAGTGCAGCGTTGATG CCAGCGCTGCACTCGATCATG CCAGATTGAAAAAAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATATTTGTCGGTGCTTTGCCAATATTTCTCTATACTAGCCAGGATTCTTTCACCAGCGCTGCACTCGATCATGTTTTTTAGCTCTGCTGGTTCAGGATTATCCAGATAATACGCACA 2 0 5' arm Citrus_sinensis mirbase MIR397 0.000009 tcc-MIR397 0.0000001 -49.4 ((((...(((((((((((.((((((((((((((((.((((.....(((.(.(((.....................))))..)))...)))).)))))))))))))))).)))))))))...))..))))....((.....)).............. (-49.40)