mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCTT GGAGTGATCCTGAGAACAGAGG CAACAGATGTGAAACCCCAGAGGAGTGATCCTGAGAACAGAGGGTGGCGTTGGCTTAAATTTGATTTGCATTGCTGCTGCCTGCTCCTGCCATACATTAAATCAAAAAGATTGTATGTGGCCAACGCACCTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGGGAATTCAATTGTCAATCAGCACGTGTCATCAAGTTACTCAATTGCTCTAACATTCGCTGCTTCTGATTCA 2 1 3' arm Citrus_sinensis mirbase MIR398 0.00000001 gra-MIR398 0.00000005 -83.8 ...((((..((((..((((((((.((((.((((((((((.((((((.((((((((............(((..((....)).)))......((((((....(((.....))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))).))))))))..)))).........((((..((((.....(((.........)))...))))..))))..))))..... (-83.80)